Polymorphism of SSR Markers Based on the Whole Genome Sequence of Lentinula edodes and Use in Strain Identification

 

【作者】 張丹； 巫萍； 章爐軍； 唐利華； 宋春艷； 尚曉冬； 鮑大鵬； 譚琦； 

 

【Author】 ZHANG Dan 1,WU Ping 1,2,ZHANG Lujun 1,TANG Lihua 1,SONG Chunyan 1 SHANG Xiaodong 1 ,BAO Dapeng 1,TAN Qi 1(1 Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Key Laboratory of Edible Fungi Resources and Utilization(South),Ministry of Agriculture,P.R.China;National Engineering Research Center of Edible Fungi,National R&D Center for Edible Fungi Processing,Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding of Shanghai,Shanghai 201403,China : 2 College of Life Sciences,Nanjing Agricultural University,Nanjing,Jiangsu 210095,China)

 

【機(jī)構(gòu)】 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所,農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,國(guó)家食用菌工程技術(shù)研究中心,國(guó)家食用菌加工技術(shù)研發(fā)分中心,上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室； 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院； 

 

【摘要】 利用香菇(Lentinula edodes)全基因組序列信息開發(fā)的35個(gè)香菇SSR(simple sequence repeat)分子標(biāo)記用于中國(guó)25個(gè)香菇品種的鑒定。所選SSR標(biāo)記共檢測(cè)出174個(gè)條帶,各引物檢測(cè)到的條帶數(shù)量變化范圍為2～12。篩選出的7對(duì)SSR引物組合顯示了良好的品種特異性鑒定能力,可以有效地鑒定部分國(guó)審香菇品種。 

 

【關(guān)鍵詞】 香菇； 全基因組序列； SSR； 品種鑒定； 

 

【文內(nèi)圖片】

圖１香菇１３５菌株單核體和轉(zhuǎn)錄組的ＳＳＲ標(biāo)記分布Ｆｉｇ．１ＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＳＳＲｓｉｎｍｏｎｏｋａｒｙｏｎｓａｎｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆＬ．ｅｄｏｄｅｓ１３５

圖２香菇１３５菌株單核體和轉(zhuǎn)錄組的ｍｏｔｉｆ類型次數(shù)分布Ｆｉｇ．２ＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＳＳＲｍｏｔｉｆｓｉｎｍｏｎｏｋａｒｙｏｎｓａｎｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆＬ．ｅｄｏｄｅｓ１３５

 

【基金】 上海市科委重點(diǎn)科技攻關(guān)項(xiàng)目(編號(hào):10391900900);種業(yè)發(fā)展專項(xiàng)[編號(hào):滬農(nóng)科種字(2012)第6號(hào)]的部分研究?jī)?nèi)容~~

 

【分類號(hào)】S646.12