【作者】劉靖宇 江玉姬 謝寶貴 陳炳智 嚴(yán)俊杰
【機(jī)構(gòu)】山西農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心
【摘要】采用iTRAQ標(biāo)記結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)對(duì)草菇不同成熟階段的差異蛋白質(zhì)組進(jìn)行研究。首先將提取的草菇不同成熟階段蛋白樣品進(jìn)行SDS‐PAGE分析,其次將經(jīng)二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)獲取的串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)通過(guò)MASCOT軟件搜庫(kù),之后對(duì)鑒定蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)進(jìn)行了KEGG代謝通路分析。試驗(yàn)共計(jì)獲得2 335個(gè)不同肽段,鑒定到1 039個(gè)蛋白質(zhì),其中1 030個(gè)蛋白質(zhì)具有定量信息。與蛋形期相比,在伸長(zhǎng)期和成熟期階段顯著上調(diào)蛋白質(zhì)85個(gè),下調(diào)蛋白質(zhì)103個(gè)。KEGG代謝通路分析結(jié)果顯示,草菇不同成熟階段中的68個(gè)差異蛋白質(zhì)可定位于4種傘菌目模式真菌(灰蓋鬼傘、雙色蠟?zāi)?、可可叢枝病菌和裂褶?的45個(gè)不同生物代謝途徑,全景展示出草菇成熟階段差異表達(dá)蛋白質(zhì)定位的代謝網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果表明,iTRAQ標(biāo)記技術(shù)結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜可對(duì)不同生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期的草菇蛋白樣品進(jìn)行有效地分離和鑒定。
【基金】山西農(nóng)業(yè)大學(xué)科研啟動(dòng)基金(No.xb2012019); 國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31301826); 國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(No.CARS24); 草菇育種崗位資助;
【關(guān)鍵詞】草菇; KEGG代謝通路分析; iTRAQ標(biāo)記; 二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜;