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    基于LSU和ITS的青藏高原黃綠卷毛菇種群遺傳多樣性分析


    【發(fā)布日期】:2019-01-21  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】謝占玲 田飛 余靜 聶守一 趙聯(lián)正 張佳偉 雷亞男 郭璟
    【機(jī)構(gòu)】青海大學(xué)生態(tài)環(huán)境工程學(xué)院國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地 青海省高原作物種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
    【摘要】為研究黃綠卷毛菇群體遺傳結(jié)構(gòu),以青海、西藏、四川3個(gè)省份的10個(gè)地理群共91個(gè)樣本黃綠卷毛菇為實(shí)驗(yàn)材料,采用分子生物學(xué)方法測(cè)定和分析所有樣本的LSU和ITS序列。結(jié)果顯示:1 995bp的LSU和ITS基因序列共有8個(gè)變異位點(diǎn),得到20個(gè)基因型。單倍型多樣性指數(shù)(Hd)和核苷酸多樣性指數(shù)(pi)分別為0.538±0.026和0.00029±0.00002;青海玉樹和青海興海的遺傳多樣性指數(shù)最高。分子變異分析結(jié)果表明黃綠卷毛菇群體遺傳變異主要來自種群內(nèi)(75.70%),種群間遺傳分化較大。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果也表明,10個(gè)地理群分成2個(gè)支系,黃綠卷毛菇群體存在明顯的地理結(jié)構(gòu)。中性檢測(cè)結(jié)果進(jìn)一步證實(shí),黃綠卷毛菇群體有著復(fù)雜的群體歷史,曾發(fā)生過種群數(shù)量擴(kuò)張,近期種群數(shù)量正在衰減。
    【基金】國家自然科學(xué)基金(31260021); 青海省科技廳資助項(xiàng)目(2014-Z-903); 青海大學(xué)高層次人才項(xiàng)目(2012-QGC-4);
    【關(guān)鍵詞】黃綠卷毛菇; 核糖體大亞基基因組序列; 內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列; 遺傳多樣性;
     
     
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