【作者】王威 丑天勝 劉芳 嚴(yán)俊杰 吳塔菊 李少杰 謝寶貴
【機(jī)構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院菌物研究中心 中國科學(xué)院微生物研究所
摘要：對金針菇Flammulina velutipes單核菌絲W23的菌絲體以及與L11質(zhì)配后的雙核菌絲H1123菌絲體進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序,以本實(shí)驗(yàn)室已獲得的W23基因組為參考基因組研究兩樣本間差異基因,并對這些差異基因進(jìn)行了GO功能和Pathway顯著性富集分析。差異基因分析顯示,兩個樣本中共有顯著性差異表達(dá)的基因3 504個,其中在雙核菌絲中上調(diào)、下調(diào)的基因數(shù)分別為2 151和1 353個。研究發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因含有很多的轉(zhuǎn)錄因子基因、蛋白激酶以及WD40 repeat-like蛋白。Gene ontology(GO)功能分析結(jié)果表明,extracellular region和membrane-enclosed lumen條目下的差異基因全部為上調(diào)表達(dá),而envelope下的差異基因全部為下調(diào)表達(dá),以利于雙核菌絲分裂時鎖狀聯(lián)合的形成而便于核的遷移。Pathway功能富集分析結(jié)果表明,脂肪酸、氨基酸以及大部分糖類合成相關(guān)基因具有比較活躍的上調(diào)表達(dá)。說明雙核菌絲主要進(jìn)行營養(yǎng)物質(zhì)的富集,為下一步在合適條件下分化成原基,進(jìn)入生殖生長階段儲備物質(zhì)基礎(chǔ)。
基金：國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973項(xiàng)目)(2014CB138302)； 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS24)；
關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)錄組; 差異表達(dá)基因; GO功能; Pathway分析;