【作者】饒佳 鮑大鵬 李燕 汪瀅 程向陽 王瑩
【機(jī)構(gòu)】國家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部 南方食用菌資源利用專業(yè)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所 上海海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院
摘要：在前期工作中發(fā)現(xiàn)草菇含有30個GH61家族基因同源物（Vvgh611至Vvgh6130）,進(jìn)一步分析了這些基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)以及其編碼蛋白基本性質(zhì)和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,并研究了Cu2+和Mn2+對基因表達(dá)水平的影響。分析表明有17個草菇GH61基因串聯(lián)成6個基因簇,存在明顯的串聯(lián)重復(fù)現(xiàn)象,系統(tǒng)發(fā)育樹與基因外顯子位置分析表明串聯(lián)重復(fù)基因分布在同一進(jìn)化分枝上并具有相似的基因結(jié)構(gòu),串聯(lián)重復(fù)基因編碼序列一致性在71%–94%之間。草菇GH61編碼蛋白的氨基酸數(shù)目在217–442aa之間,分子量和等電點(diǎn)分別介于22.4–45.4k Da和5.2–9.3之間,絕大多數(shù)都含有信號肽并定位在細(xì)胞外,都含有Glycohydro61功能域以及CBM1、peroxidase等多樣化的功能域,系統(tǒng)進(jìn)化樹表明草菇GH61家族基因具有3個主要進(jìn)化分枝,與灰蓋鬼傘等的GH61基因有較近的進(jìn)化關(guān)系。金屬離子誘導(dǎo)作用顯示,Mn2+對草菇GH61家族基因的表達(dá)水平存在誘導(dǎo)作用而Cu2+的誘導(dǎo)作用不明顯。 還原
基金：上海市科技人才計(jì)劃項(xiàng)目(13XD1424700)~~；
關(guān)鍵詞：草菇; GH61家族; 串聯(lián)重復(fù); 基因表達(dá);