近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所農(nóng)產(chǎn)品加工微生物遺傳改良與應(yīng)用團(tuán)隊(duì)在猴頭菇遺傳學(xué)研究方面取得重要進(jìn)展。科學(xué)家基于全基因組的單核苷酸多態(tài)性,表征了猴頭菇重組交換事件,這是首次在大型真菌中采用數(shù)量遺傳學(xué)來(lái)解析重組變異的遺傳機(jī)制,研究結(jié)果有利于加深大型真菌減數(shù)分裂同源重組的理解。相關(guān)研究成果已在線發(fā)表。
據(jù)龔文兵副研究員介紹,猴頭菇作為一種重要的大型真菌,具有很高的食用和藥用價(jià)值,有“山珍猴頭、海味燕窩”之稱??茖W(xué)家基于全基因組的單核苷酸多態(tài)性,表征了猴頭菇重組交換事件,鑒定了59個(gè)重組交換熱點(diǎn)區(qū)域及其富集基序,并挖掘了調(diào)控重組變異的遺傳位點(diǎn)。同源重組是減數(shù)分裂中的一個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié),為有性生殖生物提供了大量的遺傳變異,是遺傳多樣性和物種進(jìn)化適應(yīng)性的基礎(chǔ)。獲得的猴頭菇基因組,全基因組范圍內(nèi)的單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記,高精度的遺傳圖譜是極為寶貴的大數(shù)據(jù)資源,為猴頭菇生物學(xué)及遺傳改良研究奠定了基礎(chǔ)。結(jié)合二代和三代測(cè)序技術(shù),科學(xué)家先期完成了猴頭菇高質(zhì)量基因組組裝,構(gòu)建了猴頭菇首個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記數(shù)據(jù)庫(kù)。采用基因組重測(cè)序,構(gòu)建了猴頭菇首張高精度的連鎖圖譜,也是目前食用菌中密度最高的遺傳圖譜。
相關(guān)研究得到中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程、國(guó)家自然科學(xué)基金及湖南省自然科學(xué)基金等項(xiàng)目資助。
猴頭菇基因組特征及重組交換分布
原文鏈接:
(1)https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0944501320305607
(2)https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.03129/full
(3)https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754319305506