【作者】陳美元 廖劍華 李洪榮 蔡志欣 郭仲杰 王澤生
【機構(gòu)】福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所
摘要:為探討雙孢蘑菇子實體發(fā)育不同階段的蛋白質(zhì)表達變化,對雙孢蘑菇As2796菌株子實體原基期、幼菇期、采收期、開傘期的蛋白質(zhì)組進行了二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(i TRAQ-MS/MS)分析,共獲得不同肽段5 869個,鑒定到1 059個蛋白質(zhì),其中1 007個具有相對定量信息。與雙孢蘑菇原基期相比,幼菇期、采收期和開傘期分別有差異蛋白質(zhì)242、200、240個,分別占鑒定蛋白質(zhì)總數(shù)的24.0%,19.9%和23.8%。對這些蛋白質(zhì)及不同階段之間的差異蛋白質(zhì)進行了系列生物信息學(xué)分析,對8個上、下調(diào)表達具有連續(xù)性的差異蛋白質(zhì)相關(guān)基因進行了熒光定量PCR驗證,其中3個蛋白質(zhì)(錯配堿基識別蛋白、細胞色素C1及某推定的未知蛋白質(zhì))基因的轉(zhuǎn)錄與蛋白質(zhì)的表達具有較為一致的趨勢。這些結(jié)果為后續(xù)雙孢蘑菇子實體發(fā)育相關(guān)基因的功能研究奠定了良好的基礎(chǔ)。
基金:國家科技支撐計劃課題(2013BAD16B02,2012BAD14B15-04); 國家食用菌產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS24)雙孢蘑菇遺傳育種課題; 福建省農(nóng)科院科技創(chuàng)新團隊項目(STIT-1-0309)~~;
關(guān)鍵詞:食用菌; 蛋白質(zhì)組學(xué); 蛋白質(zhì)鑒定; q PCR;
【機構(gòu)】福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所
摘要:為探討雙孢蘑菇子實體發(fā)育不同階段的蛋白質(zhì)表達變化,對雙孢蘑菇As2796菌株子實體原基期、幼菇期、采收期、開傘期的蛋白質(zhì)組進行了二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(i TRAQ-MS/MS)分析,共獲得不同肽段5 869個,鑒定到1 059個蛋白質(zhì),其中1 007個具有相對定量信息。與雙孢蘑菇原基期相比,幼菇期、采收期和開傘期分別有差異蛋白質(zhì)242、200、240個,分別占鑒定蛋白質(zhì)總數(shù)的24.0%,19.9%和23.8%。對這些蛋白質(zhì)及不同階段之間的差異蛋白質(zhì)進行了系列生物信息學(xué)分析,對8個上、下調(diào)表達具有連續(xù)性的差異蛋白質(zhì)相關(guān)基因進行了熒光定量PCR驗證,其中3個蛋白質(zhì)(錯配堿基識別蛋白、細胞色素C1及某推定的未知蛋白質(zhì))基因的轉(zhuǎn)錄與蛋白質(zhì)的表達具有較為一致的趨勢。這些結(jié)果為后續(xù)雙孢蘑菇子實體發(fā)育相關(guān)基因的功能研究奠定了良好的基礎(chǔ)。
基金:國家科技支撐計劃課題(2013BAD16B02,2012BAD14B15-04); 國家食用菌產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS24)雙孢蘑菇遺傳育種課題; 福建省農(nóng)科院科技創(chuàng)新團隊項目(STIT-1-0309)~~;
關(guān)鍵詞:食用菌; 蛋白質(zhì)組學(xué); 蛋白質(zhì)鑒定; q PCR;