在食用菌的生產(chǎn)中如果不注意采取必要的預(yù)防措施，一些雜菌和害蟲會(huì)大量發(fā)生，對(duì)食用菌的生長造成很大危害。要堅(jiān)持以防為主，防重于治的原則。其發(fā)生原因主要有以下幾方面：
    　1、培養(yǎng)基營養(yǎng)豐富，既適于食用菌生長發(fā)育，也適于各種微生物的生長繁殖，只要有其他微生物存在，它們就會(huì)快速生長繁殖，造成危害。
    　2、原料在貯藏運(yùn)輸過程中受潮后，容易感染微生物，在使用時(shí)，無論是熱力滅菌還是巴氏滅菌，孢子或蟲卵都可能消除不干凈，培養(yǎng)食用菌時(shí)，它們會(huì)萌生，造成危害。
    　3、食用菌的栽培環(huán)境不清潔，或雜草叢生，或堆積雜物，或堆積廢棄的培養(yǎng)料，為滋生雜菌創(chuàng)造了條件；菇房靠近牛欄、雞舍，老菇房消毒不徹底，環(huán)境過于陰暗潮濕，通風(fēng)不良，會(huì)藏匿害蟲，滋生雜菌，在栽培食用菌之后，侵染培養(yǎng)料或子實(shí)體、菌絲體。
    　4、培養(yǎng)料營養(yǎng)成分配比不恰當(dāng)，輔料過多，含水量過大，酸堿度不適，出菇期水分管理不當(dāng)，菇房悶熱，潮濕過度，光照不足，子實(shí)體采收不及時(shí)，也會(huì)為病蟲害的發(fā)生提供條件。
    　在整個(gè)食用菌的栽培期病蟲害都可能發(fā)生，使人防不勝防。另外，雜菌和害蟲與食用菌菌絲在培養(yǎng)基內(nèi)雜生共處，很難分別采取措施處理，若不慎，還可能導(dǎo)致兩敗俱傷。因此殺蟲和滅菌是最重要的防止手段。其防治對(duì)策如下：
    　1、菌種廠的場地選擇與建設(shè)要合理。菌種廠應(yīng)遠(yuǎn)離房舍、飼養(yǎng)場、倉庫。裝料間、滅菌室、無菌室和培養(yǎng)室的建筑設(shè)計(jì)要合理，使裝好料的瓶、袋能直接進(jìn)入無菌室，接好種的菌種瓶能直接進(jìn)入培養(yǎng)室，減少轉(zhuǎn)運(yùn)的時(shí)間，減少轉(zhuǎn)運(yùn)時(shí)的污染機(jī)會(huì)。
   　 2、注意接種室、培養(yǎng)室的滅菌消毒。接種室、培養(yǎng)室的設(shè)備應(yīng)簡單整潔，室內(nèi)應(yīng)經(jīng)常打掃，清除雜物。并定期進(jìn)行甲醛熏蒸消毒。有污染的培養(yǎng)物應(yīng)立即處理，不可亂放亂丟，污染重的菌種或培養(yǎng)料袋要采取深埋處理。避免重復(fù)污染。
   　 3、注意栽培室，栽培場的衛(wèi)生。菇房、菇場應(yīng)遠(yuǎn)離倉庫、飼養(yǎng)場、垃圾場。菇房的門窗、通風(fēng)口要裝紗網(wǎng)，防止飛蟲出入。使用前應(yīng)熏蒸消毒或噴灑藥物進(jìn)行表面消毒、殺蟲。廢料及出菇后的殘料不要堆放在菇房附近。要清除菇場及其附近的枯枝爛葉、雜草及亂石堆。
   　4、培養(yǎng)料滅菌殺蟲要完全徹底。嚴(yán)格按要求對(duì)菌種培養(yǎng)基和栽培料進(jìn)行滅菌處理，高溫滅菌要做到壓力到、溫度到、時(shí)間到，不能隨意改變滅菌條件。栽培料的發(fā)酵處理有殺菌、殺蟲的作用，應(yīng)注意控制堆溫和翻堆，保證所有的堆料都經(jīng)過發(fā)酵過程。培養(yǎng)原料用前應(yīng)曝曬，覆土用前要經(jīng)消毒處理。
      5、嚴(yán)格菌種檢查，避免污染由菌種傳播。
   　6、及時(shí)清除殘菇，保持料面潔凈。采摘子實(shí)體后應(yīng)徹底清理床面，將菇根、爛菇、染害菇蕾除掉，必要時(shí)對(duì)床面進(jìn)行消毒處理。
   　7、創(chuàng)造環(huán)境條件抑制病蟲和雜菌的發(fā)生。利用雜菌、病蟲害的發(fā)生條件和食用菌的生長發(fā)育條件范圍的差距，利用或調(diào)節(jié)溫度、濕度、水分、光線、酸堿度、營養(yǎng)、空氣條件，抑制雜菌和病蟲危害，促使食用菌正常發(fā)育。