《自然》 子刊 《Nature Communications》近期發(fā)表了中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所陳士林課題組與美國、法國等合作單位關(guān)于基因組解析推動靈芝成為藥用模式真菌的論文,并以特別圖片(Featured Image)形式進行了推介,隨后《今日美國》(US TODAY)以“揭秘中國‘仙草’基因組”為題報道了該研究成果。該研究得到了國家自然科學(xué)基金委員會重點項目(項目編號:81130069)等項目的支持。
該課題組應(yīng)用光學(xué)圖譜和新一代測序技術(shù),自主完成染色體水平靈芝基因組精細圖譜,研究顯示,靈芝基因組大小約43.3Mb,由13條染色體組成,編碼16,113個預(yù)測基因,其中包括多種細胞色素P450、轉(zhuǎn)運蛋白和調(diào)控因子等與次生代謝產(chǎn)物合成、運輸和調(diào)控相關(guān)基因,是研究真菌次生代謝的理想模式物種。該研究由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所牽頭組織聯(lián)合美國田納西大學(xué)健康科學(xué)中心、美國威斯康星大學(xué)麥迪遜分校、法國??怂?馬賽大學(xué)、中國中醫(yī)科學(xué)院、美國國家綜合進化研究中心等機構(gòu)的學(xué)者組建國際化研究團隊,對靈芝基因組圖譜進行全面解析,深入探討靈芝藥用活性物質(zhì)的合成途徑及其調(diào)控機制,提出將靈芝作為中藥有效成分生物合成研究的藥用模式物種。
生物學(xué)家通過對選定的生物物種進行科學(xué)研究,用于揭示某種具有普遍規(guī)律的生命現(xiàn)象,這種被選定的生物物種被稱為模式生物。靈芝具有模式生物的鮮明特征:易于在實驗室內(nèi)培養(yǎng)和繁殖、世代短、子代多、遺傳背景清晰、容易進行實驗操作、對人體和環(huán)境無害。隨著生物學(xué)研究進入基因組時代,模式生物學(xué)研究策略受到更廣泛的關(guān)注,某些物種基因組的測序完成通常也會推動該物種向模式生物發(fā)展。與酵母等低等真菌相比,靈芝具有更復(fù)雜的有性生殖世代和更明顯的形態(tài)建成與分化;與高等藥用植物相比,靈芝具有更小的基因組和更短的世代周期。此外,靈芝遺傳轉(zhuǎn)化體系成熟,化學(xué)成分清晰,使其成為研究中藥活性成分合成與調(diào)控的理想模式物種。靈芝基因組精細圖的完成將加強靈芝在次生代謝產(chǎn)物合成與調(diào)控、次生代謝與發(fā)育相關(guān)性等研究領(lǐng)域的模式作用,推動中藥有效成分生物合成研究走向快速發(fā)展之路。全基因組解析推動靈芝成為中藥活性成分生物合成研究的首個藥用模式真菌,靈芝模式物種的確立將促進我國中藥學(xué)研究與現(xiàn)代生物學(xué)研究的結(jié)合,中藥研究正逐步走向生命科學(xué)的前沿。
該課題組應(yīng)用光學(xué)圖譜和新一代測序技術(shù),自主完成染色體水平靈芝基因組精細圖譜,研究顯示,靈芝基因組大小約43.3Mb,由13條染色體組成,編碼16,113個預(yù)測基因,其中包括多種細胞色素P450、轉(zhuǎn)運蛋白和調(diào)控因子等與次生代謝產(chǎn)物合成、運輸和調(diào)控相關(guān)基因,是研究真菌次生代謝的理想模式物種。該研究由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所牽頭組織聯(lián)合美國田納西大學(xué)健康科學(xué)中心、美國威斯康星大學(xué)麥迪遜分校、法國??怂?馬賽大學(xué)、中國中醫(yī)科學(xué)院、美國國家綜合進化研究中心等機構(gòu)的學(xué)者組建國際化研究團隊,對靈芝基因組圖譜進行全面解析,深入探討靈芝藥用活性物質(zhì)的合成途徑及其調(diào)控機制,提出將靈芝作為中藥有效成分生物合成研究的藥用模式物種。
生物學(xué)家通過對選定的生物物種進行科學(xué)研究,用于揭示某種具有普遍規(guī)律的生命現(xiàn)象,這種被選定的生物物種被稱為模式生物。靈芝具有模式生物的鮮明特征:易于在實驗室內(nèi)培養(yǎng)和繁殖、世代短、子代多、遺傳背景清晰、容易進行實驗操作、對人體和環(huán)境無害。隨著生物學(xué)研究進入基因組時代,模式生物學(xué)研究策略受到更廣泛的關(guān)注,某些物種基因組的測序完成通常也會推動該物種向模式生物發(fā)展。與酵母等低等真菌相比,靈芝具有更復(fù)雜的有性生殖世代和更明顯的形態(tài)建成與分化;與高等藥用植物相比,靈芝具有更小的基因組和更短的世代周期。此外,靈芝遺傳轉(zhuǎn)化體系成熟,化學(xué)成分清晰,使其成為研究中藥活性成分合成與調(diào)控的理想模式物種。靈芝基因組精細圖的完成將加強靈芝在次生代謝產(chǎn)物合成與調(diào)控、次生代謝與發(fā)育相關(guān)性等研究領(lǐng)域的模式作用,推動中藥有效成分生物合成研究走向快速發(fā)展之路。全基因組解析推動靈芝成為中藥活性成分生物合成研究的首個藥用模式真菌,靈芝模式物種的確立將促進我國中藥學(xué)研究與現(xiàn)代生物學(xué)研究的結(jié)合,中藥研究正逐步走向生命科學(xué)的前沿。