【作者】解凡 趙麗麗 葉麗云 吳小平

【機構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心

摘要：本文以肺形側(cè)耳栽培菌株X57為研究對象,利用高通量RNA測序技術(shù)對4℃低溫處理0h、6h和12h后的肺形側(cè)耳進行基因表達分析來探討肺形側(cè)耳低溫應(yīng)答機制。分析結(jié)果篩選出低溫處理6h差異表達基因742個,其中上調(diào)表達基因374個,下調(diào)表達基因368個;低溫處理12h差異表達基因1 489個,其中上調(diào)表達基因占53%,下調(diào)表達基因占47%。Gene ontology(GO)功能聚類分析表明,差異表達基因主要富集在結(jié)合、催化分子功能組和代謝過程、細胞過程生物學(xué)過程中。KEGG功能富集分析結(jié)果顯示,差異基因主要富集在氨基酸、核糖體和類固醇生物合成,及氮類物質(zhì)代謝的通路上,富集到與低溫脅迫相關(guān)通路MAPKsignalingpathway-yeast上的基因表達隨低溫處理時間的增加呈上調(diào)趨勢。已報道HOG-MAPK通路是MAPK途徑研究較為明確、信號傳遞單一的真菌低溫脅迫中重要的通路,本文運用生物信息學(xué)軟件構(gòu)建肺形側(cè)耳的HOG-MAPK通路,并利用熒光定量PCR對相關(guān)基因表達進行驗證,結(jié)果顯示以低溫處理0h為參照,隨著低溫脅迫時間增加通路上大部分基因的表達量持續(xù)上升,且差異顯著,與RNA-Seq分析結(jié)果一致。本文通過全面分析肺形側(cè)耳低溫脅迫時期基因表達情況,為進一步研究肺形側(cè)耳低溫脅迫相關(guān)重要基因的功能鑒定與信號通路調(diào)控機理提供基礎(chǔ)。 

 

基金：食用菌資源開發(fā)和高效加工關(guān)鍵技術(shù)研究(2018YFD0400200)； 秀珍菇品種選育及安全高效生產(chǎn)關(guān)鍵技術(shù)研究(KS115009A)~~；

 

關(guān)鍵詞：肺形側(cè)耳; 低溫脅迫; 高通量測序; 差異基因; HOG-MAPK通路;