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    香菇基因組中L-半胱氨酸亞砜裂解酶同源蛋白的生物信息學(xué)分析


    【發(fā)布日期】:2019-01-26  【來源】:菌物學(xué)報
    【作者】王瑩 鮑大鵬 楊瑞恒 陳洪雨 高英女 李燕 茅文俊 吳瑩瑩
    【機構(gòu)】國家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所
    摘要:L-半胱氨酸亞砜裂解酶(L-cysteine sulfoxide lyase,C-S lyase)是香菇中含硫風(fēng)味物質(zhì)生物合成途徑的關(guān)鍵酶之一。本文基于6個不同香菇菌株的全基因組測序數(shù)據(jù),挖掘了24個潛在的香菇L-半胱氨酸亞砜裂解酶(LentinulaedodesC-Slyase,Lecsl)同源基因,對其編碼蛋白的生理生化特性、信號肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、轉(zhuǎn)錄活性、分子進化、保守基序和蛋白三級結(jié)構(gòu)等方面進行了分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),這24個香菇Lecsl同源蛋白含有相同的蛋白結(jié)構(gòu)域(IPR015424和IPR000192),都屬于L-半胱氨酸脫巰基酶家族(PTHR43092:SF2),都不含信號肽和跨膜結(jié)構(gòu),但它們的蛋白穩(wěn)定性有所不同。對24個Lecsl同源蛋白進行聚類分析發(fā)現(xiàn),其中的11個組成了新的進化分支,這一分支的Lecsl同源蛋白在香菇的菌絲體或子實體中有轉(zhuǎn)錄活性,且含有蒜酶和L-半胱氨酸脫硫酶的保守基序19,推測這一分支的Lecsl同源蛋白在香菇中具有催化產(chǎn)生含硫風(fēng)味物質(zhì)和內(nèi)源性甲醛的活性。進一步分析發(fā)現(xiàn),這一分支又分為兩個亞支,其中一支包含已發(fā)現(xiàn)的Lecsl/LE01_CSL1,并且在香... 更多
     
    基金:上海市科委科技創(chuàng)新行動計劃(17391900400); 上海市科技興農(nóng)重點攻關(guān)項目[滬農(nóng)科攻字(2016)第6-1-3號]; 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院卓越團隊建設(shè)計劃[農(nóng)科創(chuàng)2017(A-02)]~~;
     
    關(guān)鍵詞:香菇; L-半胱氨酸亞砜裂解酶; 生物信息學(xué); 聚類分析; 關(guān)鍵氨基酸;
     
     
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