栽培草腐菌，如草菇、雞腿菇和雙孢菇以及用發(fā)酵料袋栽平菇時(shí)，一般采用自然發(fā)酵法達(dá)到原料腐熟，初步殺滅病菌蟲害的目的，但在實(shí)踐中存在很多問(wèn)題：1.中心部位厭氧發(fā)酵變酸，而外層原料變干，溫度過(guò)低不足以殺滅病蟲害；２.多次翻堆散失了溫度，也增加了勞動(dòng)量；３.常規(guī)的二次發(fā)酵是采用把原料置于封閉空間，分層放置，人工增溫的方法，雖然能彌補(bǔ)一次發(fā)酵的缺陷，但也存在設(shè)施要求高，耗費(fèi)能源多的問(wèn)題，普通農(nóng)戶很難完成，并且人員進(jìn)出封閉空間時(shí)，存在一定的危險(xiǎn)性。
　　改良的二次發(fā)酵，是在原地進(jìn)行，最大程度利用原料本身發(fā)生的熱量，添加少量輔助設(shè)備即可完成,步驟如下：
　　1、  原料一次發(fā)酵
　　按常規(guī)方法建堆，原料經(jīng)3d堆制，中心溫度達(dá)到40ºC左右時(shí)進(jìn)行第一次翻堆，由于補(bǔ)充了氧氣，再經(jīng)1—2d，堆溫可達(dá)70ºC，然后進(jìn)行第二次翻堆，經(jīng)2d原料基本腐熟，然后重新建堆，進(jìn)行二次發(fā)酵。
　　2、簡(jiǎn)易二次發(fā)酵法
　　2.1建堆要求
　　建堆時(shí)要求達(dá)到中空效果，可根據(jù)堆長(zhǎng)平行放置三根木棍，下邊用磚墊起，中間一根略高，寬度約0.8m，再用麻袋蓋住，然后把原料輕翻到上面，即所謂的“地龍”，堆仍建成原來(lái)形狀，從中間橫插一根管子，至中空部位，然后把原料用塑料膜覆蓋，周圍用磚壓住，建堆完畢。
　　2.2巴氏滅菌階段
　　控溫發(fā)酵2—3d后，原料呈紅棕色，布滿大量白色放線菌，已達(dá)到發(fā)酵目的，最后進(jìn)行巴氏滅菌：把通風(fēng)管與蒸汽發(fā)生器相連，通入蒸汽，使原料溫度達(dá)到62—65ºC，維持10h，停止，巴氏滅菌可徹底殺滅有害生物。蒸汽發(fā)生器用舊柴油桶做成，頂部引出一個(gè)出汽管和上水閥門，置于灶上，加約2/3的水后，關(guān)閉進(jìn)水閥門，燒火，水開(kāi)后，出汽管產(chǎn)生蒸汽。當(dāng)通氣發(fā)酵階段的措施可使溫度達(dá)到巴氏滅菌的溫度時(shí)，可不再使用蒸汽發(fā)生器。